Détection et quantification des biomarqueurs moléculaires
Chromatographe en phase gazeuse avec détecteur à ionisation de flame (Agilent technologies, 6890N) équipé d’un passeur automatique (Agilent technologies, 7683B)
Description de l’instrument :
Chromatographie en phase gazeuse avec détecteur à ionisation de flame (Agilent technologies, 6890N), fonctionnant avec un gaz vecteur H2.
Passeur automatique d’échantillons 100 positions (Agilent technologies, 7683B)
Principe de l'analyse :
La GC-FID permet de détecter et quantifier les lipides issus de matrices archéologiques et environnementales variées. Elle permet d’identifier les échantillons nécessitants des analyses moléculaires supplémentaire telles que les analyses structurales par GC-MS (spectrométrie de masse), isotopique par GC-IRMS (spectrométrie de masse à ratio isotopiques) sur le δ13C et δ2H et d’adapter les concentrations à la capacité des instruments, permettant ainsi de prolonger la durée de vie des consommables. Elle permet aussi de quantifier des rendements d’isolement de la GC-préparative lors de développements ciblant de nouvelles molécules pour la mesure du 14C par AMS (spectrométrie de masse par accélération) à l’échelle moléculaire.
Analyses réalisées sur l’instrument :
Profils lipidiques totaux, quantification de biomarqueurs moléculaires
Contacts :
Caroline Gauthier : Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
Emmanuelle Casanova : Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
Jérémy Jacob : Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
Financements :
Identification et quantification des biomarqueurs moléculaires
Chromatographe en phase gazeuse (Trace 1300) équippé d'un passeur automatique (AS 3000) et couplé à un spectromètre de masse simple quadripole (ISQ QD)
Description de l’instrument :
Passeur automatique (AS 3000) : Le passeur automatique prélève au moyen d'une seringue quelques µL de la fraction en solution dans un solvant organique et l'introduit dans l'injecteur du chromatographe en phase gazeuse. Il dispose de 105 positions pour héberger des flacons, ce qui lui confère une large autonomie.
Chromatographe en phase gazeuse (Trace 1300) : Lorsque la solution est introduite dans l'injecteur, les biomarqueurs moléculaires seront focalisés en tête de colonne capillaire par effet de point froid, la température de l'injecteur étant définie à 280 °C alors que le four deu chromatographe est à 50 ou 80 °C en début d'analyse. Les biomarqueurs moléculaires sont progressivement séparés dans la colonne capillaire sous flux d'hélium, lors de la montée en température du four de chromatographie (jusqu'à 300 °C en général), en fonction de leur masse moléculaire et de leur polarité.
Spectromètre de masse (ISQ QD) : Lorsque les biomarqueurs moléculaires parviennent en fin de colonne dans le spectromètre de masse ils y sont ionisés et fragmentés par impact électronique. Le spectromètre de masse déterminera la masse de chaque fragment ainsi que son abondance.
Analyses réalisées sur l’instrument :
Le résultat obtenu est sous la forme d'un chromatogramme qui reflètre l'évolution de l'abondance des fragments de molécules au cours de l'analyse et, pour chaque point d'analyse, un spectre de masse qui correspond à l'abondance des fragments de différentes masse, véritable fiche d'identité des biomarqueurs. Il reste alors à quantifier chaque biomarqueur, à l'identifier grâce à des bases de données ou à la littérature, puis à en déterminer l'origine et la signification.
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